復合顯微鏡（Compound microscope）它包括位于鏡筒兩端的物鏡和目鏡中的兩個短焦距凸透鏡(后來發展成兩組凸凹透鏡組)。下圖為1590 - Hans Janssen & Zacharias Janssen(父子)制作**個復合顯微鏡:

復合顯微鏡分為正顯微鏡和倒顯微鏡。其光路結構和原理如下：

但立體顯微鏡和解剖顯微鏡的正式名稱應為體視顯微鏡（Stereo Microscopy）；三維顯微鏡也是體視顯微鏡的昵稱。由于體視顯微鏡的許多用途是小動物解剖，解剖顯微鏡是體視顯微鏡解剖的標題。

體視顯微鏡由雙光路組成，雙光路出口對應人的兩只眼睛。在體視顯微鏡下，每只眼睛看到不同的標本成像。這些額外的信息允許大腦通過整合左右圖像來重建物體的三維圖像。因此，體視顯微鏡的成像具有傳統復合顯微鏡所沒有的三維感。當人們與標本（如解剖、篩選、微雕刻、微操作等）互動時，體視顯微鏡是一種很好的選擇工具。

   體視顯微鏡分為格里諾光路（Greenough Design）和伽利略光路（CMO Design），光路結構原理如下：

徠卡S9格里諾光路系列的典型代表：

徠卡M伽利略光路系列的典型代表：